Evaluation et caractérisation des actions bioprotectrices des souches de rhizobiaceae et de pseudomonas fluorescents face à fla fusariose vasculaire

Abstract

Les rhizobactéries phytobénéfiques constituent une source microbienne largement étudiée pour sa valorisation et son exploitation dans des pratiques agroécologiques, visant à diminuer la dépendance des intrants chimiques (pesticides et fertilisants). Le présent travail est le fruit d’une coopération entre notre laboratoire de Protection et de Valorisation de Ressources Agro-Biologiques (LPVRA) et le laboratoire Espagnol de l’institut de l’agriculture durable (IAS-CSIC), portant sur étude de comportement, d’amélioration et de sélection de génotypes de pois. Notre étude s’intéresse aux aspects de phytostimulation et de bioprotection des PGPR (Rhizobium leguminosarum et Pseudomonas fluorescens) vis-à-vis de Fusarium oxysporum f.sp pisi (Fop), agent de la fusariose vasculaire du pois. Les essais in vitro ont montré que ces rhizobactéries sont antagonistes et inhibent de façon notable le développement du pathogène dans sa croissance mycélienne (65,37%), la germination conidienne (93,98%) et l’élongation des tubes germinatifs (91,21%). L’expérimentation in situ, confirme les potentialités phytobénéfiques de ces rhizobactéries, en induisant la régression de l’expression de la maladie à des niveaux très appréciables, à des taux de bioprotection de plus de 74%. En effet le suivi de la fusariose vasculaire sur des génotypes de pois sélectionnés, montre clairement des conséquences positives directes sur la diminution de la progression de la maladie (AUDPC : Area Under the disease progress curve) pouvant atteindre 80,17%. La bactérisation a induit des gains très significatifs en biomasses fraiche et sèche, notamment avec la combinaison Pseudomonas fluorescens X Rhizobium leguminosarum bv. viceae, où les effets phytobénéfiques sont d’autant plus importants par rapport aux bactérisations individuelles. Durant nos expérimentations, une absence de nodulation du pois par la souche Rhizobium leguminosarum bv. viceae (Rlv) a été notée. L’amplification des gènes nodulants, (NodL-NodD et NodA-NodJ), a montré des bandes de tailles fortement inférieures à celles de la souche de référence Rlv 3841. La perte du plasmide responsable de la nodulation, ou une partie de celui-ci, pourrait expliquer