Les biofilms chez Staphylococcus aureus : Etude de la régulation et analyse bio-informatique

Abstract

Staphylococcus aureus, agent causal d'infections nosocomiales et de graves pathologies associées à la formation de biofilms, qui provoquent des problèmes majeurs de santé dans le monde. Comme les biofilms sont des systèmes biologiques dynamiques et complexes, S. aureus a développé un vaste réseau de mécanismes de régulation, qui se caractérise par divers facteurs de virulence et une résilience accrue aux antibiotiques et à la réponse immunitaire. Une telle situation exige des défis thérapeutiques remarquables, notamment dans les milieux hospitaliers. En plus de la présence de riches informations scientifiques, en microbiologie fondamentale et vue l'importance de cette bactérie, de nombreuses études et travaux de recherche ont abouti à des publications scientifiques de haut niveau. En explorant les bases de données notamment NCBI (National Center for Biotechnology Information), notre objectif a porté sur la réalisation d'une investigation in silico, analyse bio-informatique sur les protéines ClfB, SarA et les gènes SigB, CodY associés à la formation du biofilm et de la virulence, et la compréhension des principaux mécanismes de sa formation et de sa régulation chez S. aureus. Nos résultats sur la prédiction des structures des protéines, la recherche de similarités de séquences en utilisant les logiciels BLASTp et BLASTn, et la phylogénie des protéines en utilisant les méthodes de calcul des distances selon NJ (Neighbor Joining) et EM (évolution minimale), nous ont permis de mettre enévidenceles aspects moléculaires des gènes qui présentent des convergences et des protéines qui présentent des divergences, liés au virulence et impliqués dans la formation du biofilm chezS. aureus. Ainsi, les aspects moléculaires analysés représentent des cibles possibles pour développer des stratégies préventives et thérapeutiques, d'une meilleure stabilité et de leur exploitation biotechnologique