Contribution du biofilm et du quorum sensing dans la bioprotection par les endophytes bactériens

Abstract

Notre travail consiste à mettre en évidence l’effet bioprotecteur d’isolats bactériens endophytes et la contribution du quorum sensing et la formation du biofilm vis-à-vis des agents phytopathogènes. Nous avons isolé les bactéries endophytes associées aux racines du romarin (Rosmarinus officinalis L.). Un total de 10 isolats a été sélectionné. Une identification préliminaire des isolats a été réalisée, basée sur la description des critères culturaux, morphologique et métabolique. Les bactéries identifiées comprennent des coques à Gram positif, des coques à Gram négatif, des bacilles à Gram négatif et une cocobacille à Gram positif. La coloration au vert de malachite a mis en évidence la présence de spores chez trois isolats (Rm1, Rm2, et Rm10). La recherche des enzymes respiratoire a montré que tous les isolats endophytes sont catalase (+), tandis que trois isolats seulement sont oxydase (+). La confrontation directe in vitro des isolats endophytes avec la souche phytopathogène de Fusarium oxysporum f.sp. albidinis a signalé le pouvoir antagoniste de la souche Rm2, alors que les autres isolats ont enregistré une activité antagoniste moins importante. La mise en évidence in vitro de la formation de biofilm a été effectuée selon deux techniques : l’ensemencement sur gélose rouge Congo et la quantification sur microplaques. Les résultats de ces deux techniques ont été en accord en confirmant la capacité de 7 isolats endophytes à produire des biofilms