Les Méthodes de reconstruction phylogénétique: Modèles, Exploitation des Logiciels et Applications à Medicago L. (Fabaceae.)

Abstract

Les Méthodes de reconstruction phylogénétique : Modèles, Exploitation des Logiciels et Applications à Vicia Medicago L. (Fabaceae). Résumé : Dans ce mémoire, nous avons tout d’abord exposé la méthodologie de la reconstruction phylogénétique : Nous avons abordé les problèmes de l’échantillonnage, le choix des caractères donc, nous avons récupérer les séquencesnucléotidique de la base de donnéeGenBank, on a trouve que M.truncatula et M.sativa sont les deux espèces les plusétudiées dans le genre Medicago, et le gène qui est le plus utilisé pour la phylogénieet le gène chloroplastique, qui s’est avéré le plus utile pour les analyses phylogénétiques. Les séquences chloroplastiques obtenus seront traitées par le logiciel MEGA 5 en passant par un alignement multiple en utilisant le programme ClustalW, puis la méthode(UPGMA) pour inférer les phylogénies du genre Medicago. Les groupements taxonomiques générés par les phylogénies obtenues pour 43 espèces sur une combinaison des séquences chloroplastiques sont congruents entre eux mais pas avec ceux d’autres auteurs sur d’autres données et avec la classification traditionnelle excepté pour Medicago Sect. Intertextae. Nos résultats démontrent aussi la monophylie du genre Medicago vis-à-vis du genre proche Trigonella.