Analyse bioinformatique du rôle des LncRNAs (long non codingRNAs) et leur contribution dans le diabète type 1

Abstract

Des analyses génomiques à grande échelle ont mis en évidence l’existence d’une multitude de longs ARN non codants (lncRNA). Bien que la fonction de la majorité de ces lncRNA reste à l’heure actuelle inexplorée, la récente identification des longs ARN non codants et le début de leur caractérisation fonctionnelle dans une variété de tissus constituent des avancées scientifiques majeures. Il semble clair que plusieurs de ces transcrits jouent un rôle important dans la régulation de l’expression génique et sont impliqués dans diverses pathologies, notamment le diabète. Malgré un fort intérêt à caractériser le transcriptome des différents types de cellules humains pour comprendre la base moléculaire du diabète, on a accordé très peu d'attention au rôle des LncRNAs et leur contribution dans le diabète type1. Pour cela nous nous sommes intéressés dans cette étude in silico à travers l’utilisation des données de transcriptome d’une lignée cellulaire de cellules beta pancréatiques à comprendre les bases moléculaire du diabète et le rôle potentiel des lncRNAs dans la dysrégulation des fonctions des cellules β dansdiabète type 1, en mettant l'accent sur les loci génomiques Divers outils bioinformatique s’offrent à nous pour ce travail telques : Galaxy, GeneMANIA, String, Blast et Uniprot. Nos résultats nous offrent la possibilité de confirmer le rôle des Lnc RNA dans l’émergence du diabète type1