Isolement, sélection et identification de champignons endophytes du palmier dattier (Phœnix dactylifera L.) et antagonistes à l’égard du Fusarium oxysporum f.sp albedinis.

Abstract

Notre travail a porté sur l’étude de la biodiversité des champignons endophytes du palmier dattier et leur interaction avec une souche pathogène de Fusarium oxysporum fsp. Albedinis (Foa). L’isolement des champignons a été réalisé à partir de 5 variétés résistantes au bayoud ; Elhorra, Azouzia, Mech Degla, Takerboucht et Bentqbala et une sensible, en l’occurrence, la variété Deglet Nour. Les résultats des isolements ont révélé que certains champignons endophytes isolés des différentes variétés présentent des ressemblances morphologiques alors que d’autres sont différents morphologiquement. La caractérisation macroscopique a permis de rassembler l’ensemble des isolats endophytes dans 27 morphotypes différents qui ont par la suite subi les tests d’antagonisme in vitro vis-à-vis de Fusarium oxysporum fsp. albedinis. Le test d’antagonisme a été mené selon deux protocoles, le premier par dépôt en co-culture simultané de l’endophyte et du Foa et le second par dépôt tardif du F.o.a, soit, 48 h après l’ensemencement du disque mycélien de l’endophyte. L’analyse des résultats a révélé que plus de 60% des isolats endophytes se révèlent antagonistes lors du dépôt tardif, alors que 25% seulement de ces mêmes isolats se sont montrés antagonistes envers le Foa lors de la coculture

simultanée. Les taux d’inhibition les plus significatifs sont représentés par ceux des souches de Fusarium sp et des Diaporthe sp isolées de la variété Elhorra. L’observation microscopique couplée à l’identification par des clés de détermination a mis en évidence deux genres de champignons ; Fusarium et Diaporthe. Les autres isolats antagonistes n’ayant pas sporulé dans nos conditions de stress thermique et exposition des isolats à la lumière, ont été définis appartenir au groupe des DSE (Dark Septate Endophytes) et aux Mycelia sterilia, connus comme des groupes majeurs d’endophytes fongiques d’espèces végétales vivant en milieu aride.