Caractérisation morphologique et analyse génomique in silico d'Alternaria spp

Abstract

Ce mémoire porte sur l’étude comparative de Alternaria alternata et Alternaria solani, deux agents majeurs de l’alternariose chez la tomate et la pomme de terre. L’objectif est d’identifier leurs stratégies de virulence respectives à travers une approche combinant observations morphologiques en laboratoire et analyses génomiques in silico. Les travaux expérimentaux ont été réalisés au laboratoire de fin d’études de l’Université de Blida 1. Des isolats fongiques ont été obtenus à partir d’échantillons infectés, cultivés sur milieu PDA, puis caractérisés par observation microscopique. Le logiciel ImageJ a été utilisé pour la mesure morphométrique des conidies. Sur le plan bioinformatique, deux génomes de référence (A. alternata Z7 et A. solani NL03003) ont été analysés. Les gènes de virulence ciblés incluent le cluster PKS chez A. alternata et le gène effecteur AsCEP112 chez A. solani. Les comparaisons ont été effectuées à l’aide des logiciels BLAST, ClustalW et MEGA X pour l’analyse phylogénétique. Les résultats mettent en évidence deux stratégies distinctes de pathogénicité : une production de toxines nécrogènes chez A. alternata et une suppression immunitaire par effecteurs protéiques chez A. solani. Ces conclusions offrent des perspectives pour le développement de méthodes de diagnostic moléculaire et de stratégies de gestion phytosanitaire ciblées