Caractérisation morphologique et moléculaire des botryosphaeriaceae associées au dépérissement du chêne dans différentes régions de l'Algérie

Abstract

L’objectif de ce travail est de mettre en évidence, les différents agents fongiques pathogènes de la famille des Botryosphaeriaceae impliqués dans le dépérissement du chêne en Algérie. A cet effet, nous avons mené nos expérimentations dans quatre parcs nationaux à savoir le parc national d’El- Kala, le parc national de Belezma (Batna), le parc national de Chréa (Blida) et le parc national de Tlemcen. En étudiant 67 arbres présentant les symptômes typiques de dépérissement, nous avons pu remarquer six types de nécroses ; les nécroses brunes en position sectorielle étaient les plus dominantes par rapport aux autres avec un taux de 33%. Plusieurs agents fongiques ont été isolés à partir de ces différentes nécroses, un total de 200 isolats a pu être obtenu, une analyse préliminaire nous a permis de constater l’existence des Botryosphaeriaceae, Biscogniauxia et Cytospora avec des fréquences d’isolement de 56%, 24% et 20% respectivement. Les caractérisations morphologique et moléculaire des isolats appartenant à la famille des Botryosphaeriaceae nous ont permis d’identifier trois espèces faisant partie de trois genre différents ; Diplodia corticola (la plus isolée avec une fréquence de 64,51%), Botryosphaeria dothidea (19,35%) et Dothiorella iberica (16,13%), ces trois espèces ont été identifiées sur la base des séquences ITS sauf pour le genre Diplodia où nous avons rajouté l’amplification du EF; un test de pathogénicité a été effectué à la fin de notre travail en inoculant des branches de chêne vert et de chêne liège avec des isolats de D. corticola et B. dothidea, ce test a montré que ces deux espèces sont pathogènes avec une virulence beaucoup plus marquée chez D. corticola et que Quercus ilex est plus résistant à ces agents fongiques de Quercus suber ; les postulats de koch ont été aussi confirmés.