Etude de Polymorphisme du gène aldose réductase par méthode bioinformatique et pathologies associées.

Abstract

L'aldose réductase (AR) est une oxydoréductase monomère dépendant de NADPH ayant de larges spécificités de substrat pour les composés carbonylés. Cette enzyme cytosolique catalyse la conversion du glucose en sorbitol. Le gène AKR1B1 est situé sur le chromosome 7 en position 33 du bras long (7q33) avec une longueur de 18 kb contient 10 exons. Notre étude vise à étudier l'association du polymorphisme du gène de l'aldose réductase (AKR1B1) avec les pathologies humaines en identifiant les polymorphismes à nucléotide unique (SNP) à l’aide de bases de données internationales et des outils bio-informatiques comme NCBI, LitVar, UCSC, Galaxy, Ensemble. Dans notre étude nous n’avons retenu que les variations polymorphiques pathologiques. Grâce a l’analyse bioinformatique nous avons pu identifier les différents polymorphismes mononucléotidiques SNPs majeurs de l’AR associé à plusieurs pathologies. Le rs779176563 est significativement associé au cancer colorectal et utérin. Le rs1480104657 est une variante qui provoque des défauts du tube neural. Le variant rs2229542 et rs5053 s’associent à l’asthme et à la rhinite. Le rs758266634 est associé à la néphropathie diabétique (DN) tandis que les variants rs3896278, rs17188118 et rs1424426 du gène AKR1B1 sont significativement associées à la rétinopathie diabétique (RD). Ces polymorphismes peuvent altérer la fonction de l’aldose réductase en modifiant sa structure ce qui pourrait contribuer à réduire ou à augmenter les niveaux d’expression de la protéine et à l’altération de la fonction globale de l'AKR1B1. Nous suggérons que ces SNPs peuvent être utilisés pour des études cas-témoin, comme des marqueurs génétiques.