Etude in Silico du gène SOD2 (superoxyde dismutase mitochondriale, chr6) dans le cas du cancer

Abstract

Le gène humain SOD2 codée pour une SOD hautement régulée dans le noyau c'est le MnSOD (SuperoxydeDismutase du Manganèse) qui se trouve dans les mitochondries, pour lutter contre les radicaux libres qui y sont produits; et transforme le superoxyde produit par les mitochondries en peroxyde d'hydrogène et en oxygène moins toxiques. Ce gène est situé en position 6q25 et se compose de 5 exons. Cette enzyme antioxydante est essentielle à la survie des organismes aérobies et joue un rôle antiapoptotique contre le stress oxydatif, les cytokines inflammatoires et les rayonnements ionisants, et joue également un rôle dans le développement du cancer, en fonction de son expression basale. Pour cela nous nous sommes intéressés dans cette étude in silico à travers l'utilisation des données de transcriptome de SOD2. L'étude in silico du polymorphisme du gène SOD2 en utilisant une méthodologie bioinformatique au moyen de l'analyse de diverses bases de données et de navigateurs Web open source telle que NCBI . UCSC a montré que le polymorphisme SOD2 Val-9Ala peut contribuer au développement du cancer par le biais d'un équilibre antioxydant perturbé.