Les mycoendophytes de L’avoine spontanée (Avenasterilisssp.sterilis): Inventaire et potentiel antifongique

Abstract

Notre travail porte sur l’étude de la diversité taxonomique des mycoendophytes de l’avoine spontanée et leur interaction avec deux champignons phytopathogènes (Fusarium oxysporum et Helminthosporium sp.). L’isolement des mycoendophytes a été réalisé à partir des chaumes de l’avoine. Certains mycoendophytes isolés présentent des ressemblances morphologiques. La caractérisation macroscopique a permis de rassembler l’ensemble des isolats endopyhtes dans 13 morphotypes différents qui ont par la suite subit les tests d’antagonismes in-vitro vis-à-vis des deux champignons phytopathogènes. Les différents Phylum du règne fongique sont représentés par, au moins une espèce mycoendophyte. L’abondance des taxons selon leur appartenance aux divers Phylum est très diversifiée. Les Zygomycota sont les plus abondants (61,76%), suivies par les Deuteromycota (32,35%) puis, à part égale, par les Ascomycota et les Basidiomycota (2,94%) .L’observation microscopique couplée à l’identification par des clés de détermination a mis en évidence 06 taxons. En effet, sur les 13 isolats, 06 ont été déterminées jusqu’au genre. Il s’agit de : Alternaria sp. (Deuteromycota), Penicillium sp1. (Deuteromycota), Ulicladium sp. (Deuteromycota), Penicillium sp2.(Deuteromycota), Geotrichum sp.(Ascomycota), Rhizoctonia sp (Basidiomycota). Le test d’antagonisme a été mené par dépôt en co-culture simultané de l’endophyte et des champignons phytopathogènes. La totalité des isolats endophytes se révèlent antagonistes envers le Fusarium oxysporum et Helminthosporium sp. Parmi les taxons identifiés, Penicillium sp2.Présente un taux d’inhibition des plus significatifs (43,59%) à l’égard d’Helminthosporium sp. tandis que Geotrichum sp. induit une réaction antagoniste importante (52%) envers Fusarium oxysporum.