Résumé:
Souvent, La diarrhée néonatale de l'agneau constitue un problème préoccupant aussi bien pour l'éleveur que pour le vétérinaire. La morbidité et la mortalité sont élevées, engendrant des pertes économiques considérables. La présente étude s'articule sur quatre volets menée dans différentes régions du centre d'Algérie 1-Une enquête de prévalence de Cryptospridium sp. chez les ovins et la relation avec certains facteurs connus comme prédisposant à l'infestation cryptosporidienne. 2-Une enquête sur l'éventuelle association avec Giardia et Emeria sp chez les agneaux de 1à 6 mois. 3-Une enquête de prévalence sur les 4 principaux agents pathogènes Cryptospridium sp, E-coli, Rotavirus, Coronavirus responsables de la diarrhée en fonction du statut clinique et l'âge des agneaux. 4- Enquête sur la détection des oocystes de Cryptospridium sp. dans les fèces des agneaux par deux méthodes: Immuno-enzymatique (ELISA) et la coloration de Ziehl-Neelsen modifiée et recherche des éventuelles lésions du à Cryptospridium sp sur des agneaux trouvés mort au moment du prélèvement. La première enquête nous a permis de montrer que les quarante troupeaux ont fourni un résultat positif au dépistage de Cryptosporidium sp. soit une prévalence troupeau de 84 % [IC95 % 75 % - 93 %]. La prévalence individuelle globale était 12,4 %, la prévalence de l'infestation des agneaux, de 13,5 %, de 10 % pour les brebis et de 3,4 % pour les béliers (p < 0,05). Elles ne concernent cependant que l'échantillon étudié La deuxième enquête a montré que les cryptosporidies marquent la prévalence la plus élevée suivies de Giardia et Eimeria a des taux différents, les cryptosporidies sont isolés pendant les deux premières semaines de vie, alors que Giardia et Eimeria infestent les agneaux les plus âgés, d'où apparait l'importance de l'âge comme facteur prédisposant à l'infestation. La troisième enquête à fournit les résultats suivant : une prévalence des cryptosporidies (18%), suivi du colibacille F5 (K99+) (12%), le rotavirus (9%), et enfin le coronavirus (5%). Les différents germes sont plus retrouvés isolés qu'associés, leurs prévalence a été plus importante chez les agneaux diarrhéiques, 39% pour Cryptosporidium sp, 23% E-coli, 21% Rotavirus et 15 % Coronavirus. Rotavirus est plus fréquemment détecté chez les agneaux pendent la première quinzaine de vie soit (17%) ainsi que E-coli soit (15%), pour cryptosporidium sp, il a été détecté surtout durant la deuxième quinzaine de vie soit 28%. En outre aucune infection n'a été détectée pour rotavirus et coronavirus, dans cette période. La quatrième enquête a décrit que la méthode microscopique s'est montrée moins efficace pour la détection des oocystes de Cryptospridium sp. le test de khideux montre qu'il y a une différence significative entre les deux méthodes P <0.05 et le test de Kappa = 0.577 montre une concordance moyenne entre les deux techniques.
