Caractérisation des mycobactéries responsables de la tuberculose respiratoire et génitale chez l'homme et les bovins dans la région centre de l'Algérie

Abstract

La tuberculose (TB) est une maladie importante chez les animaux et l’homme dans le monde. Le génotypage est très utile pour comprendre l'épidémiologie de la TB. En Algérie, les données sur l'épidémiologie de ces infections et les génotypes du complexe M. tuberculosis (CMT) sont en grande partie inconnues. Dans ce contexte, nous avons mené une étude sur la diversité génétique des souches du CMT isolées chez l’homme et les bovins dans deux provinces de la région Centre de l'Algérie à l'aide d'outils moléculaires. Au total, 296 souches du CMT ont été isolées à partir de 181 échantillons de tissus présentant des lésions suspectes de TB bovine et 115 de cas de TB humaine. Tous les isolats ont été génotypés par spoligotypage. L'identification des espèces a montré la présence de 107 M. tuberculosis, 07 M. bovis et un "M. pinnipedii " chez l’homme et 174 isolats M. bovis, trois M. caprae, trois " M. pinnipedii " et un " M. microti " chez les bovins. L'analyse phylogénique a identifié 97 spoligotypes différents, représentés par 36 clusters et 61 isolats uniques. Dans l'ensemble, 264 isolats (89,2%) appartenaient au 72 différents types internationaux SIT ou SB, tandis que 24 isolats (8,1%) ont été considérés comme « orphelins » et huit isolats d’origine bovine ont été attribués à sept nouveaux profils SB (SB2695 à SB2701). Les isolats de M. tuberculosis ont été classés en six familles dont la Méditerranée latino-américaine (LAM, 29%), T (21,5%), Haarlem (19,6%), Ural (5,6%), S (1,9%) et USA (0,9%).Concernant M. bovis, trois profils de spoligotype (SB0120, SB0121 et SB0134) étaient prédominants en Algérie, comme dans d'autres pays d'Afrique du Nord et vingt-huit des spoligotypes sont signalés pour la première fois en Algérie. La présente étude a montré une grande diversité génétique des souches CMT isolées chez l'homme et les bovins dans le Centre de l'Algérie avec l'isolement de souches de M. bovis chez l'homme suggérant une transmission zoonotique de la TB bovine, ce qui nécessite des études moléculaires supplémentaires pour déterminer la proportion d'infection humaine par M. bovis.