Isolement et identification des champignons rhizosphériques du palmier dattier et l’étude de leurs activités antimicrobiennes

Abstract

L’isolement et l’identification des champignons rhizospheriques de palmier dattier dans la région Knadsa (W. Bechar) à fait l’objet de ce modeste travail afin de collecter des souches utilisées pour des activités antimicrobiennes plus spécialement contre les bactéries multirésistances . L’isolement de cette population fongique est réalisé à partir de 4 cultivars (Hmira, Hamriya, Tinaser et Feggous). 51 isolats fongiques ont été obtenus et ont subi une identification sur la base des caractères macroscopiques et microscopiques. Une diversité fongique est constatée et ces isolats ont été classés dans 20 groupes affiliés à 8 genres dont Aspergillus, Fusarium, Acremonium, Pythium, Rhizoctonia, Penicillium, Botryosphaeria et Monilinia. L'étude de l'activité antimicrobienne a été mise en évidence à partir de 4 filtrats de culture des espèces suivants : Aspergillus niger, Aspergillus sp, Aspergillus sp et Penicillium sp vis à vis d’E.coli, P.aeruginosa, S.aureus. K.pneumoniae et C.albicans par l’utilisation de trois méthodes: confrontation directe, méthode des disques et des puits. L'étude de l'activité antimicrobienne a révélée une variabilité de l'effet inhibiteur des champignons exercé sur les souches testées. La détermination de l'activité antagoniste d'Aspergillus niger a révélé leur capacité à inhiber la croissance des bactéries à Gram négatifs E.coli, P.aeruginosa, K.pneumoniae. Contrairement à la bactérie Gram positif S.aureus et la levure C.albicans qui n’ont montré aucun effet inhibiteur. La souche de Penicillium sp présente un effet antimicrobien seule contre E.coli tandis que pour les 2 souches d'Aspergillus sp aucun effet n'a été observée vis à vis des souches testées. La méthode de diffusion sur disques montre qu’Aspergillus sp a exercé une activité inhibitrice contre E.coli et P.aeruginosa qui se traduit par des zones d’inhibition qui varient entre 9 mm et 13mm respectivement. En présence de P.aeruginosa des zones d'inhibition de 9 mm et 11mm ont été enregistrée en contact avec Aspergillus niger et Penicillium sp respectivement. Alors que pour Aspergillus sp aucune activité n’a été observée. Par contre, l’utilisation de la méthode de diffusion par puits na montré aucune activité antimicrobienne pour les quatre souches testées et cela peut être dû à la faible concentration des métabolites secondaires dans les filtrats utilisés.