Caractérisation biochimique et physiologique des bactéries rhizosphériques du palmier dattier

Abstract

L.objectif de cette etude est l.isolement et la caracterisation biochimique, physiologique et enzymatique des bacteries non fluorescentes a partir de sol rhizospherique de cultivars de palmier dattier dans la region de Taghit. L.isolement par la methode de suspensions-dilutions a permis d.obtenir differents caracteres morphologiques, parmi lesquels, 30 isolats bacteriens non fluorescents ont ete selectionnes par le test de florescence sur le milieu de culture King B. La caracterisation phenotypique et biochimique des isolats a montre une variete des souches isolees. Les resultats obtenus nous ont orientes vers 8 genres differents Parmi ces souches on a 26% souches qui representent le genre Azotobacter ,10% souches qui appartiennent au genre Agrobacterium, 10% souches qui appartient au genre Chromobacterium et 10% souches sont des Rhizobia, 27% souches appartenant au genre Bacillus et 7% souches qui representent le genre Azospirillum , 7% souches de Burkholderia et 3% souche qui appartiennent a l.espece Arthrobacter cumminsii. L.evaluation du potentiel PGPR des bacteries a montre que plusieurs souches sont capables de produire l.acide indole acetique, et HCN, l.ammoniac et la solubilisation du phosphate. Les 30 isolats ont la capacite de formation de biofilm significatif qualitativement et quantitativement par la methode des eppendorfs apres 20 h d.incubation la lecture de la densite optique (DO) de la phase du biofilm chez les bacteries identifiees probablement en tant qu.especes Bacillus sp, Chromobacterium sp.hyper productrice du biofilm a DO 2.5. Toutefois, les bacteries Agrobacterium sp. et Azotobacter sp. Se sont revelees faiblement productrices du biofilm a DO 0.5. Le test de L.antagonisme in vitro de 16 souches parmi la collection presentant la plus forte production de biofilm a ete realisee sur deux souches pathogenes : une clinique humaine Escherichia coli et l.autre phytopathogenes Agrobacterium tumefaciens C58. Les resultats ont montre que 5 souches ont une forte activite antagoniste qui sont Bacillus, Azotobacter sp. et Chromobacterium presentant contre les bacteries pathogenes avec des diametres des zones d.inhibition importants qui varient entre 2 mm .En revanche, les bacteries Burkholderia sp., Rhizobia sp. , Agrobacterium sp. Ne presentent aucun effet antibacterien