La violacéine chez Chromqbacterium violaceum:Quorum-Sensing,étude in silico

Abstract

Chromobacterium violaceum est une Betaproteobacteria Gram-négatif, de la famille de Neisseriaceae, coccobacille anaérobie facultative et non sporulant. Cette bactérie est largement utilisée dans les laboratoires de microbiologie impliqués dans la recherche sur le quorum sensing (QS). Parmi les caractéristiques régulées par le quorum sensing, la production de violacéine a reçu la plus grande attention. Ce pigment a une valeur d'application médicale potentielle, en qualité d’antibactériens, d’antiulcéreux et d’anticancéreux. Du fait de son intérêt pour des applications biotechnologiques, la compréhension et l'étude des mécanismes de sa régulation génétique est évidente et plus qu’indispensable. Après avoir consulté les nouveautés des publications scientifiques, nous avons élaboré une revue bibliographique pour réaliser une synthèse sur les caractéristiques microbiologiques de base de cette bactérie et la biosynthèse de son pigment, tout en abordant l'aspect global du concept du quorum sensing, notamment sa régulation chez C. violaceum. A l'aide de méthodes de recherche bioinformatiques (in silico), nous chercherons de comparer les phylogénies moléculaires (régulation génétique et biosynthèse) pour souligner les propriétés génétiques et protéiques de ce pigment. Les résultats de l’analyse bioinformatique ont montré que la protéine régulatrice CviR chez C. violaceum ATCC12472 est une homologue avec presque toutes les protéines régulatrices LuxR, elle présente une structure bien précise qui assure une régulation et un contrôle pour l'expression des gènes de l’opéron Vio qui sont en nombre de 5 gènes (VioA, VioB, VioC, VioD et VioE). Ces gènes sont disponibles chez toutes les souches de C. violaceum et existent chez d’autre espèces du genre Chromobacterium, mais ils ne sont pas complètement identiques, ce qui explique pourquoi seulement les espèces de C. violaceum ont la capacité de synthèse du pigment de violacéine