Optimisation de l’hémoculture

Abstract

La bactériémie est une affection grave et redoutée, du fait d’une mortalité associée élevée. Les hémocultures sont considérées comme la méthode de référence pour le diagnostic de la bactériémie et font partie des fonctions les plusimportantes du laboratoire de microbiologie clinique. Des hémocultures négatives signent dans la plupart des cas l’absence de bactéries dans le sang. Toutefois, devant un contexte clinique évocateur de syndrome infectieux, il faut toujours garder à l’esprit que l’hémoculture peut être faussement négative, du fait d'un prélèvement effectué au moment non optimal ou sous antibiothérapie, quantité de sang ensemencée insuffisante, longue durée de stockage avant l'incubation, … Cette thèse fait le point sur les données récentes pour éviter les faux négatifs, et améliorer le temps et le rendement des hémocultures. Dans cette thèse, nous présentons aussi une discussion approfondie des questions liées au problème de la contamination des hémocultures. Les questions abordées comprennent la portée et l'ampleur du problème, les bactéries les plus souvent reconnues comme des contaminants, l'impact de la contamination des hémocultures sur le fonctionnement du laboratoire de microbiologie clinique, et, peut-être le plus important, une discussion systématique des solutions au problème. ABSTRACT Bacteremia is a serious and dreaded condition, due to the high associated mortality. Blood cultures are regarded as the gold standard for diagnosis of bacteremia and are among the most important functions of the clinical microbiology laboratory.Negative blood cultures sign in most cases the absence of bacteria in the blood. However, faced with a clinical context suggestive of an infectious syndrome, it should always be borne in mind that the blood culture may be falsely negative, due to a sample taken at the non-optimal time or under antibiotic therapy, insufficient quantity of blood inoculated, long storage time before incubation, … This thesis reviews recent data to avoid false negatives, and improve the time and yield of blood cultures. In this thesis, we also present a comprehensive discussion of matters related to the problem of blood culture contamination. Issues addressed include the scope and magnitude of the problem, the bacteria most often recognized as contaminants, the impact of blood culture contamination on clinical microbiology laboratory function, and, perhaps most importantly, a systematic discussion of solutions to the problem.