Etude transcriptomique de l'expression des profils microRNA dans la polyarthrite rhumatoïde

Abstract

La polyarthrite rhumatoïde (PR) est l'arthropathie inflammatoire la plus fréquente dans le monde. Elle est caractérisée par la présence d'auto anticorps dirigés contre le peptide citrulliné cyclique (anti-CCP) et le facteur rhumatoïde (FR) . L'objectif de cette présente étude est d'identifier le profil des micro-RNA exprimés de manière différentielle In Silico à l'aide de divers outils bioinformatiques à savoir (NCBI GEO2R, Limma R, Target Scan Human, miRDB, miRBase, BioRender) chez une population atteintes de PR afin de déterminer le rôle biologique de leurs gènes cible et l'interaction entre ces derniers. Pour cela un total de 46 individus ont été sélectionnés : vint huit (28) patients atteints d'arthrite rhumatoïde et dix-huit (18) témoins sains . Quinze (15) micro-RNA exprimés de manière différentielle ont été révélés : miR-101 , miR-142 , miR-1468 , miR-1184-1 , miR-1246 , miRN-1247 , miR-4423 , miR-4445 , miR- 4448 , miR-4644 , miR-3529 , miR-6880 , miR-4531 ,miR-6880 ,miR-4531 .Parmi ces gènes 2 micro-ARN sur exprimés chez les patients PR, le miR-5583 et le miR-8067 qui ont comme gène cible IL-6 / VEZF1 et RPTPK / PDGFR qui jouent un rôle protecteur lors de la chronicité de l'inflammation. Par ailleurs 13 micro-ARN ont été retrouvés sous exprimés ont un rôle de régulation négatif qui ont comme gènes cibles : MMP-13, CXCL-12, PTPN2 IKZF2, STAT 3 , SP1, FOXK2, FCRL3, NFAT5, IL12RB1, Dyrk1A, CCR3, VEGFA , DLG1 , CXCL5 … Cette étude permet d'explorer des biomarqueurs pronostiques afin d'améliorer le diagnostic précoce de la PR en se basant sur les micro-ARN pour mettre en évidence les voies biologiques importantes pour la transition vers maladie détectable