Isolement et identification biochimique et physiologique des bactéries endophytes isolées de plantes halophytes de deux régions (Relizane et Chlef).

Abstract

Des plantes halophytes ainsi que le sol environnant ont été collectés de deux sols salés situésà Chlef et Relizane. L’isolement et la caractérisation de bactéries endophytes a eu lieu à partir des plantes halophytes dominantes dans les deux parcelles de ces régions.

L’étude physico-chimique montre que les deux sols sont de nature calcairo-sableuse de pH alcalin ; celui de Chlef présente une conductivité électrique de 2.23 dS/cm, celui deRelizane sa conductivité est de de 6 dS/cm indiquant par conséquent une salinité marquante. L’identification botanique des plantes halophytes montre que celles-ci appartiennent aux familles des Chenopodiaceae, Asteraceae, Euphorbiaceae et Scrofulariaceae. Un total de53 isolats bactériens endophytes différents ont été isolés à partir des espèces végétalesdominantes dans les deux parcelles d’étude et appartenant aux genres Salicornia sp., Suaedasp., Chrysanthemum sp., Linaria sp.et Euphorbia sp.

Les résultats de la caractérisation biochimique et physiologique révèlent des isolats apparentés à 15 types de profils différents. Les Gram + sont homogènes et sont confinés dans 5 profils, les Gram – sont plus hétérogènes et se répartissent dans les 10 autres profils restantsLa fréquence des isolats par plante étudiée révèle que le genre Salicornia est représenté par lenombre le plus élevé de profils (32%), alors que chez le genre Linaria, les profils bactériens ne sont représentés que de 13%. Les autres genres partagent sensiblement les mêmes valeurs de représentativité des différents profils bactériens, soit, 21, 17 et 16%, pour respectivement,Chrysanthemum, Suaeda et Euphorbia. La comparaison des fréquences des isolats bactérienset de leurs profils correspondants, montre qu’ils se retrouvent équitablement répartis dans lapartie racinaire et dans la partie aérienne. Les résultats obtenus révèlent une diversitéphénotypique, biochimique et physiologique des endophytes hébergés par les différents genres botaniques analysés et mettent en évidence des bactéries halotolérantes (croissance surNaCl 20% à T°≥ 30°C), réparties à la fois chez les deux groupes de bactéries.