Optimisation de la production de l’acide indole -3- acétiques par les souches de Pseudomonas spp. fluorescents

Abstract

Dans un contexte de transition vers une agriculture plus respectueuse de l’environnement, les bactéries bénéfiques offrent une alternative intéressante aux intrants chimiques. Parmi elles, Pseudomonas spp. fluorescents se distinguent par leur capacité à produire divers métabolites secondaires qui stimulent la croissance et renforcent la santé des plantes. Le présent travail a pour objectif de mettre en évidence la production de l’acide indole acétique(AIA), une phytohormone reconnue pour son rôle essentiel dans la croissance racinaire chez dix souches de Pseudomonas spp. fluorescents isolées à partir de la rhizosphère et l’endophytosphere du palmier dattier et à optimiser les paramètres influençant cette biosynthèse. La caractérisation phénotypique (examen macro et microscopique) et biochimique (galeries API 20 E) de ces souches a confirmé leur appartenance à l’espèce de Pseudomonas fluorescens. La production d’AIA a été observée chez l’ensemble des souches, avec des taux variable. Les plus fortes concentrations ont été enregistrées chez les souches F27 (10,581 μg/ml), TR7 (10,308 μg/ml) et CF1 (8,907 μg/ml), tandis que la souche TC1 a présenté la plus faible production (0,747 μg/ml). L’optimisation des paramètres de biosynthèse chez les souches les plus performantes (CF1, TR7, F27) a révélé que plusieurs paramètres influencent cette biosynthèse, notamment la température, le temps d’incubation, le pH du milieu, la concentration de tryptophane, ainsi que la nature de source d’azote et de carbone. L’identification de l’AIA par chromatographie sur couche mince (CCM) a révélé la présence d’un composé avec un Rf = 0,88 dans les extraits des souches F48, TR7 et CF1 identique à celui du standard, confirmant la présence de l’AIA ainsi que d'autres métabolites. Par ailleurs, l’analyse par chromatographie liquide à haute performance (HPLC) a permis de corroborer la présence d’AIA dans l’extrait filtré de la souche F27, sur la base d’un temps de rétention (13,7 min) et de spectres UV (219,6 nm et 278,8 nm) similaires à ceux du standard. Enfin, l’évaluation de l’effet de la bactérisation des graines de tomate (Saint Pierre) sur la stimulation de la germination et sur l’indice de vigueur a montré des différences notables entre les quatre traitements testés, en comparaison au témoin. Toutefois, l’analyse statistique (ANOVA) n’a révélé aucune différence significative entre les traitements au seuil de 5 %. Ces résultats renforcent l’intérêt d’exploiter les Pseudomonas fluorescens dans le développement de solutions biologiques pour une agriculture plus durable