Recherche dans les sols algériens d’actinobactéries à activité antifongique

Abstract

L’analyse de deux échantillons de sols provenant des régions de Boumerdès et Mostaganem a permis de récolter 88 isolats d’actinobactéries sur les milieux « chitine- agar» et « glycérolasparagine- agar » additionnés de vitamines B et d’agents sélectifs. Les isolats obtenus ont fait l’objet d’une étude taxonomique basée sur les critères macro et micro-morphologiques. Cette étude a montré une diversité importante des actinobactéries dans les sols étudiés. Le sol de Mostaganem s’est montré plus riche en actinobactéries du point de vue du nombre d’isolats sélectionnés (54 isolats) et de la diversité des genres (6 genres) par rapport au sol de Boumerdès (34 isolats appartenant à 4 genres). Les souches ont été rattachées d’une manière présomptive à 7 genres différents dont la majorité appartient au genre Streptomyces (51 souches) qui est le genre le plus fréquent du sol. Les 37 autres isolats ont été identifiées à 6 genres peu fréquents à rares :Actinomadura (2 souches), Saccharothrix (12 souche), Nocardiopsis (2 souches), Amycolatopsis (6 souches), Nocardia (12 souche) et Actinoplanes (3 souches). L’activité antifongique des 88 souches d’actinobactéries cultivées sur le milieu ISP2 solide a été évaluée contre 4 champignons filamenteux phytopathogènes et/ou toxinogènes et une levure pathogène pour l’homme par la technique des cylindres d’agar. Parmi les 88 souches d’actinobactéries 63 (74%) ont montré une activité antifongique contre au moins un champignonscible. L’activité antifongique a été estimée à 100% chez Actinomadura et Actinoplanes, 83,33% chez Amycolatopsis, 72,55 chez Streptomyces, 66,66% chez Nocardia, 58,33% chez Saccharothrix et 50% chez Nocardiopsis. Cette étude a révélée qu’une souche nommée Bm21 possède les meilleures activités antifongiques contre tous les champignons cibles testés avec des diamètres d’inhibition allant de 15 à 22 mm. La majorité des métabolites antifongiques sécrétées par nos souches d’actinobactéries ont une action contre Aspergilles carbonarius, Fusarium culmorum et Phaeomoniella chlamydospora (36 à 40 souches actives contres ces champignons). Par contre, peu de souches ont montré une activité contre Phaeoacremonium aleophilum et Candida albicans (7 à 12 souches actives uniquement).