Evaluation de quelques paramètres métaboliques dans le cas du Charcot chez le diabétique(In silico)

Abstract

Le pied Charcot est une complication du diabète caractérisée par une inflammation locale dont plusieurs protéines sont impliquées. Notre travail porte sur l'étude in silico d'un panel de protéines impliquées dans l’inflammation du pied Charcot diabétique :TNFSF11(facteur de nécrose tumorale superfamille member11),TNFRSF11B (facteur de nécrose tumorale Receptor superfamily member 11 B), TNFRSF11A (facteur de nécrose tumorale Receptor superfamily member 11A) , CRP (protéine C-reactive) , Insuline, VDR (récepteur de la vitamine D), GADP1 (ganglioside induced differentiation associated protein 1) , MPZ ( myelin protein zero), Il-6 (interleukine 6), Il-1β (interleukine 1β), CD14 (cluster de différenciation 14). En se basant sur l'utilisation des bases de données protéomiques grâce aux outils bioinformatiques open source. Les formes Fasta des protéines ont été récupérés par la base de données NCBI,l'obtention des séquences protéiques et l'alignement par Uniprot,ensuite les domaines importants des protéines et l'analyse fonctionnelle sont effectués par Interpro,l'obtention de la structure 3D des protéines par Expasy et finalement le réseau d'interaction des protéines est réalisé par Gene Mania. Nos résultats confirment l'association des protéines étudiées dans la physiopathologie du pied Charcot grâce aux interactions moléculaires des gènes de protéines. Ces résultats peuvent nous aider aussi à comprendre les voies et la prédiction des fonctions des protéines et leur rôle dons le pied Charcot.