département de biologie des populations organismesdépartement de biologie des populations organismeshttps://di.univ-blida.dz/jspui/handle/123456789/732024-03-29T14:37:31Z2024-03-29T14:37:31ZEtude par outils bio-informatiques de quelques mutations de la protéine Spike du corona virus variant omicronGuelai, Radjahttps://di.univ-blida.dz/jspui/handle/123456789/222752023-03-06T12:36:34Z2022-09-01T00:00:00ZEtude par outils bio-informatiques de quelques mutations de la protéine Spike du corona virus variant omicron
Guelai, Radja
D’après l’OMS la pandémie de COVID-19 causée par le virus SARS-CoV-2 a entraîné plus de 600 millions d'infections et 6,5 millions de décès dans le monde. La variante Omicron récemment apparue a soulevé de sérieuses inquiétudes quant à la réduction de l'efficacité des vaccins et des anticorps neutralisants en raison de son grand nombre de mutations notamment au niveau de la protéine de surface connue par (SPIKE PROTEINE).
Dans cette étude, on a sélectionné 15 mutations les plus connues et les plus présentes chez le variant omicron : (A67V, T95I, S371L, S373P, S375F, N404K, G446S, S477N, E484A, Q493R, Q498R, N501Y, Y505H, N856K, N969K) toute ces mutations causent des substitutions d’acide aminé, on a utilisé une combinaison d'approches in silico conventionnelles et avancées basées sur des réseaux de neurones pour prédire comment ces mutations affecteraient la protéine de pointe.
On a étudié l’impact de ces mutations chez le variant omicron de différent coté (phylogénétique, physicochimique, fonctionnel, structural, interactionnel) et d’utiliser plusieurs et différents outils bio-informatique. On a aussi analysé l’interaction (RBD-ACE2) en effectuant un amarrage moléculaire.
Les résultats ont démontré une augmentation de l'alcalinité de la protéine d’un point isoélectrique de 1.5 à 7, une modification de l’hydrophobicité, variations des résidus fonctionnels, le taux de distance entre les 5 variant VOC connues et que le variant Alpha étant le plus proche au variant omicron on a déduit aussi que le variant omicron contenant les 15 mutations est distant de 6.03577 paire de base par rapport à la (WIV04) séquence de GISAID utilisé comme séquence référence
Les résultats de l’amarrage indique que le RBD du variant Omicron avait une affinité plus élevée que la référence. De plus, des simulations de dynamique moléculaire de tous les atomes ont conclu que le RBD de la variante Omicron présente un réseau d'interaction plus dispersé puisque les mutations ont entraîné une augmentation du nombre d'interactions hydrophobes et de liaisons hydrogène avec hACE2
Ill. ;tabl. ;dvd ;70 p.
2022-09-01T00:00:00ZVarious epigenetic modulations of genetic expression in the strive against stressBelabdelouahab, RymaDriouche, Nour elhoudahttps://di.univ-blida.dz/jspui/handle/123456789/222732023-03-06T12:28:34Z2022-09-01T00:00:00ZVarious epigenetic modulations of genetic expression in the strive against stress
Belabdelouahab, Ryma; Driouche, Nour elhouda
Il est confirmé que le stress cause des modifications épigénétique qui provoque l'apparition de plusieurs pathologies. Il parait que le traitement de ces modifications épigénétiques ne se fait pas forcément à travers des médicaments comme on l'a toujours connue, mais peut se faire à travers des interventions entre le mental et le corps physique.
Aujourd'hui les gens se penchent sur ça de plus en plus, qu'il est invraisemblable que de tels interventions peuvent apporter des changements au niveau moléculaire et physique. Serait-il ce concept vrai ou pas ?
Maintenant à travers une recherche bibliographique, on est arrivé a démontré que des moyens comme les interventions entre le mental et le corps physique peuvent rétablir un désordre épigénétique.
Les interventions entre le psychique et le somatique (psychosomatique), induisent non seulement des changements psychologiques, tels que l’atténuation de la dépression, de l’anxiété et du stress, mais aussi des changements physiologiques tels que l’activation parasympathique, une sécrétion de cortisol plus faible, une inflammation réduite et un retard du vieillissement et diverses autres processus vitaux, qui sont tous des facteurs de risque de maladies multiples. Le lien étroit entre le mental et le physique dans un état d’influence mutuelle installe soit une pathologie soit un rétablissement d’un désordre étant à l’origine de cette maladie. Ca parviendrait donc à restaurer les désordres épigénétiques en modulant l’expression des gènes impliqués. Pour cela nous avons étudier 23 articles, ce qui nous a valu plusieurs résultats concernant multiples types de méditations, yoga, Tai Chi, Qigong, MBSR, la pleine conscience et la relaxation, qui ont eu un impact sur de diverses pathologies, le diabète de type 2 pris comme exemple détaillé, a montré que ces pratiques pourraient diminuer le glucose du sang.
Donc en effet aujourd'hui on peut dire que de tels moyens de méditations peuvent mettre en place un équilibre entre le mental et le physique, peuvent rétablir un désordre épigénétique et permettent de vivre en protégé du stress pour une vie pleine de santé et de bonne qualité
Ill. ;tabl. ;dvd ;89 p.
2022-09-01T00:00:00ZEtudes des différents aspects épidémiologiques de la leishmaniose canine de l’AlgéroisMenad, Mehdihttps://di.univ-blida.dz/jspui/handle/123456789/222712023-03-06T12:25:32Z2022-07-01T00:00:00ZEtudes des différents aspects épidémiologiques de la leishmaniose canine de l’Algérois
Menad, Mehdi
La leishmaniose à Leishmania infantum est une parasitose due à un protozoaire flagellé et transmise à son hôte par un insecte vecteur, le Phlébotome. Le chien est la principale espèce parasitée par L. infantum et constitue son principal réservoir. S'agissant d'une zoonose, l'homme peut être lui aussi infecté.
En Algérie, la LCan constitue un problème de santé publique. Vu le potentiel zoonotique de la maladie, il est important de contrôler l'infection chez le chien réservoir pour prévenir la leishmaniose viscérale zoonotique humaine mortelle en absence de traitement et la leishmaniose cutanée sporadique qui laisse des cicatrices indélébiles.
Les souches canines utilisées dans ce travail proviennent de la cryo banque du LEEPGP de l’IPA. Trois zymodèmes MON-1, MON-80 et MON-34 de plusieurs régions d’Alger et de Tizi-Ouzou ont été sélectionnés pour identification moléculaire par PCR-ITS1 et PCR-Hsp70.
La PCR-RFLP du gène ITS1 à confirmer les résultats du typage iso enzymatique longtemps utilisés dans la caractérisation taxonomiques des espèces de Leishmania. Cependant il n’a pas pu révéler une discrimination des différents variant généralement rencontrés chez L. infantum de l’Algérie, nécessitant de cibler d’autres marqueurs moléculaires comme la HSp70
Ill. ;tabl. ;dvd ;49 p.
2022-07-01T00:00:00ZEtude « in silico » et identification de quelques oncogènes (& variants) grâce au modèle tumoral, cas des leucémies.Aib, NesrineBendekfal, Zinebhttps://di.univ-blida.dz/jspui/handle/123456789/222702023-03-06T12:23:02Z2022-09-01T00:00:00ZEtude « in silico » et identification de quelques oncogènes (& variants) grâce au modèle tumoral, cas des leucémies.
Aib, Nesrine; Bendekfal, Zineb
Les leucémies sont des maladies clonales et acquises de la cellule souche hématopoïétique ou d’un précurseur déjà commis vers les lignées lymphoïde et/ou myéloïde.
Le clonage moléculaire de remaniements chromosomiques récurrents a permis d’identifier de nombreuses altérations géniques qui constituent des outils diagnostiques et de suivi thérapeutique maintenant pris en compte dans les nouveaux critères de classification des leucémies.
Les domaines de certains gènes marquent les oncogènes clés et sont associés à des gènes dérégulés dans le cancer, dans notre thèse – Les leucémies.
De vastes domaines de gènes ont été associés après leur séquençage à des oncogènes leucémiques.
Notre objectif est d’identifier les oncogènes leucémiques et leurs variants in silico en nous basant sur des recherches documentaires sur des travaux d’études d’identification in vivo déjà réalisés sur les oncogènes leucémiques, en vue d’initier une approche de diagnostic prédictif de cas pareils de leucémies par séquençage génomique, basé sur des données d’études réalisées in vivo disponibles sur les plateformes bioinformatiques.
Ici, nous avons identifié les gènes associés aux domaines leucémies, les oncogènes et leurs variants.
Nous étudierons théoriquement l'expression de gènes dérégulés dans les leucémies, à savoir les variants oncogéniques afin de prouver que les leucémies humaines est un processus de transformation par étapes selon les mutations des oncogènes et de leurs variants.
Ceci par l’utilisation de données open-source du séquençage de différents modèles et d'un tas de pipelines bioinformatiques.
Le développement récent de thérapeutiques ciblées sur l’activité ou la stabilité d’une protéine oncogénique a été illustré ici, par les succès thérapeutiques obtenus dans le traitement des leucémies
Ill. ;tabl. ;dvd ;59 p.
2022-09-01T00:00:00Z