Recherche et identification des bactéries endophytes antagonistes de Fusarium oxysporum f.sp. albedinis agent pathogène du bayoud sur le palmier dattier (Phoenix dactilifera L).

Abstract

Notre travail a porté sur l’étude de la biodiversité des bactéries endophytes du palmier dattier et leur interaction avec une souche pathogène de Fusarium oxysporum f. sp. albedenis (F.o.a). L’isolement des bactéries a été réalisé à partir de cinq variétés résistantes au bayoud : Mech Deglat, Benteqbala, Elhorra, Elazouzia et Takerboucht et une variété très sensible Deglet Nour. Les résultats des isolements ont révélé que certaines bactéries endophytes isolées des différentes variétés présentent des ressemblances morphologiques alors que d’autres sont différentes morphologiquement. La caractérisation macroscopique a permis de différencier l’ensemble des isolats endophytes dans 32 types morphologiques différents qui ont par la suite subi les tests d’antagonisme in-vitro vis-à-vis de Fusarium oxysporum f. sp. albedenis. Le test d’antagonisme a été mené selon deux protocoles, premièrement, par dépôt en coculture simultanée de l’endophyte et du F.o.a et par effet des inhibiteurs non volatiles produits par les antagonistes (micro-filtrats bactériens) en second lieu. La première technique a permis de montrer que 34,37% des isolats ont eu un effet antagoniste avec une diversité de l’action se manifestant sous forme de zones d’inhibitions de tailles variables. Un total de 11souches affiche un taux d’inhibition supérieur à 20%. Ces mêmes souches testées par la seconde méthode par l’utilisation des microfiltrats révèlent un taux de 63,63% des isolats endophytes présentant un taux d’inhibition supérieur à 20%. L’étude des caractères biochimiques des souches antagonistes à travers le test de coloration de Gram, la recherche des enzymes de type oxydase et catalase, le test de fluorescence sur le milieu King B et le type respiratoire, nous a permis de mettre en évidence le genre Bacillus spp. et un autre genre apparenté. Le genre Bacillus représente un groupe hétérogène de bactéries et regroupe des espèces endophytes largement décrites pour leurs diverses activités biologiques.