Caractérisation polyphasique et potentiel antagoniste de quelques souches d'actinobactéries

Abstract

Un total de 16 isolats provenant d'une collection d'actinobactéries isolées du sol par Meklat a été étudié de point de vu taxinomique et potentiel antagoniste. La taxinomie des 16 actinobactéries a été étudiée en utilisant une approche polyphasique basée sur les caractérisations morphologique, physiologiqueet moléculaire (séquençage et analyse phylogénétique de l'ADN ribosomique 16S).Les résultats obtenus nous ont permis de classer nos isolats danssix genres fréquents à rares; Streptomyces (9 souches), Streptosporangium (3 souches), Microbispora (1 souche), Nocardia (1 souche), Nocardiopsis/ Saccharothrix (1 souche) et un genre non identifié (1 souche).Une des souches deStreptomyces et les trois souches de Streptosporangium partagent de faibles similarités d'ADNr 16S (inférieure à 98,65 %) avec les espèces les plus proches de chaque genre, ce qui confirme la présence d'au moins 4 nouvelles espèces. Le potentiel antagoniste des 16 souches d'actinobactéries a été évalué contre huit germes-cibles sur le milieu ISP2 par la technique des cylindres d'agar. 12souches (75 %) se sont montrées actives contre au moins un germe-cible.L'activité antimicrobienne est estimée à 100 % desStreptomyces et Nocardiopsis/ Saccharothrix et33,3% desStreptosporangium. L'activité antibactérienne est obtenue uniquement contre les bactéries à Gram positif et elle est relativement plus intéressante que l'activité antifongique. L'évaluation du potentiel antagoniste des 16 souches d'actinobactériesen utilisant des cylindres d'agar provenant des milieux synthétiques constitués de quelques sucres qui favorisent leur croissance contre trois germes-cibles a montré que62,5 % des souchessont actives, ce quiest inférieur par rapport à l'activité obtenu sur le milieu ISP2.Cependant, certaines souches inactives sur ISP2 ont montré une activité sur le milieu synthétique additionné des sucres comme est le cas de la souche D8.