Diversité génétique des souches de Mycobacterium tuberculosis typée par spoligotyping isolées au niveau de la region centre de l'Algerie

Abstract

La tuberculose est une maladie infectieuse et contagieuse en pleine recrudescence et dont la surveillance épidémiologique a été renforcée par des techniques de biologie moléculaire. Notre travail s’est basé sur le typage moléculaire par Spoligotyping des souches de Mycobacterium tuberculosis isolées de patients tuberculeux diagnostiqués dans le centre de l’Algérie. Cette étude a été effectuée sur un échantillon de 79 souches isolées de Mycobacterium tuberculosis de patients atteints de tuberculose durant l’année 2011. L’analyse des profils obtenus nous a permis de mettre en évidence trois familles génomiques dominantes : la famille Haarlem (N=24), la famille T (N=22) et la famille LAM (N=18) (Latino- américaine et méditerranéenne). L’analyse des spoligotypes a révélé 29 profils uniques et 09 grappes. Ces dernières sont représentées par : le ST n° 53/T1 (N=14), le ST n° 118/T2 (N=3), le ST n° 196/T1 (N=2).

le ST n° 50/H3 (N=12), le ST n° 39/H3 (N=3), le ST n°134/H1(N=3),

le ST n° 3/H3 (N=2), le ST n° 42/LAM9 (N=9) et enfin le ST n° 34/S (N=2).

La technique utilisée dans cette étude est le spoligotyping, qui doit être complétée par des techniques plus discriminantes telles que le RFLP-IS6110 et MIRUs-VNTR.