Résumé:
Le rocher de sel de Djelfa constitue un exemple typique d’environnements
hypersalins qui peut héberger une grande variété de microorganismes halophiles
dans des conditions physico-chimiques hostiles. Compte tenu de l’importance de
l’étude des microorganismes halophiles qui y sont présents en termes de la
microbiologie fondamentale et appliquée, les saumures du rocher de sel de Djelfa
ont été étudiées pour explorer la diversité microbienne procaryote par des
approches culture-dépendante et indépendante et sélectionner les souches
archéennes halophiles productrices d’enzymes hydrolytiques extracellulaires. Au
total 30 isolats archéens ont été isolés, identifiés par approche polyphasique et
testés qualitativement pour la production d’enzymes hydrolytiques extracellulaires
(amylase, cellulase, caséinase, gélatinase, estérase, lipase et lécithinase). Sur la
base des lipides polaires et le séquençage de l’ADNr 16S, l’analyse de la diversité
culturale archéenne des échantillons de saumures du rocher de sel indiquait que
les isolats archéens ont été affilés à quatre genres de la classe Halobacteria à
savoir Haloarcula (57%), Halorubrum (17%), Halobacterium (13%) et Haloferax
(13%).
L’analyse de la diversité microbienne procaryote de quatre échantillons de
saumures du rocher de sel par la métagénomique ciblée de la technologie NGS
montrait que malgré les conditions hostiles, le rocher de sel supporte une
communauté diverse des archées affiliées au phylum Euryarchaeota (15,3%) et à
la classe Halobacteria avec 18 genres et 4 familles. Les séquences affiliées au
domaine Bacteria, étaient assignées aux phyla : Proteobacteria (57,2%),
Firmicutes (15,4%), Bacteroidetes (11,7%) et Actinobacteria (12,7%). D’autres
phyla minoritaires ont également été détectés comme Balneolaeota,
Rhodothermaeota et Cyanobacteria.
Le screening d’activités enzymatiques hydrolytiques extracellulaires chez
les isolats archéens a révélé que la gélatinase et l’amylase sont les activités les
plus abondantes chez les souches testées. L’activité estérase est classée en
troisième position suivie par l’activité lécithinase. Les activités lipase et cellulase
n’étaient pas observées chez les souches testées. La production combinée de
plusieurs enzymes hydrolytiques a été observée chez 26,66% des isolats.
Ce rapport constitue une étude préliminaire sur la diversité microbienne
procaryote du rocher de sel de Djelfa en utilisant à la fois la métagénomique ciblée
de la technologie NGS et les techniques culturales.
