ISOLEMENT, CARACTERISATION ET ACTIVITE ANTAGONISTE DES ACTINOBACTERIES DE BIOTOPE MARIN

Abstract

La biodiversité et la recherches de nouvelles espèces d’actinobacteries en milieu marin ainsi que leur potentiel antagoniste ont été étudiés dans 6 échantillons provenant de 3 différentes cotes de l’Algérie: Cherchelle, Gouraya et Tipaza. Au totale, 19 souches d’actinobacteries marines ont été isolés en utilisant le milieu chitine-vitamines agar (Ch-V) additionné des agents sélectifs: un antifongique (Actidione 50 mg L-1) et certain antibiotiques (Acide nalidixique 10 mg L-1 et pénicilline 25 mg L-1). Tout le prélèvement analysé contient des actinobactéries et tous les milieux testés ont permis l’isolement d’un nombre variable de souches. La taxonomie et la diversité de la population d’actinobacteries isolées ont été évaluées en se basant sur des études morphologiques. Les résultats ont montré une certaine diversité dans la communauté des actinobacteries au niveau des prélèvements côtière étudiés. Les souches ont été affiliées à quatre genres fréquents à peu fréquents: Streptomyce (68, 42% du totale), Nocardiopsis/ Saccharothrix (26, 32%) et Rhodococcus (5, 26 %). Le pouvoir antagoniste des 19 souches isolées a été évalué contre plusieurs germes-cibles sur le milieu ISP 2 solide par la méthode des cylindres d’agar. 16 se sont montrées actives contre au moins un germe-cible. En revanche, 3 souches n’ont présenté aucune activité. L'activité antimicrobienne est estimée à 100% chez les Nocardiopsis/ Saccharothrix suivis de 84,6% chez Streptomyces. Cependant, l’unique isolat de Rhodococcus (TB1) n’a montré aucune activité. Cette étude a révélée qu’une souche (TA4) possède une forte activité contre deux bactéries à Gram positif (Staphylococcus aureus 639c résistante à la méticilline et Bacillus subtilis ATCC 6633) sur le milieu ISP 2 et moins importante sur 20 autres milieux synthétiques contenant des sources de carbones divers. Une approche polyphasique: morphologique, physiologique et moléculaire (séquençage de du gene codant pour l’ARNr 16S) avec une étude phylogénétique approfondie) lui a été consacrée, cette dernière a rapproché cette souche des espèces de Streptomyces olivaceus et S. pactum avec un pourcentage de similarité égale à 99,79 %. La production d’antibiotiques de la souche TA4 a été effectuée dans le milieu ISP 2 liquide pendant 10 jours. La cinétique de la production de des molécules bioactives est suivie quotidiennement contre Staphylococcus aureus 639c résistante à la méticilline par la méthode de diffusion des puits, elle a montré que l’incubation pendant 5 jours donne une meilleure activité. Ce résultat a été confirmé par une deuxième cinétique par la méthode de diffusion de disque de papiers imbibés par les extraits à l’acétate d’éthyle et au dichlorométhane. La deuxième cinétique montre aussi que la plus grande activité antibactérienne a été obtenue avec l’extrait à l’acétate d’éthyle. L’analyse par HPLC de cet extrait montre la présence de deux composés hydrophobes et le spectre UV-visible montre qu’ils sont de nature aromatique ou hétérocyclique.