Recherche des espèces de Fusarium Spp. et de leurs mycotoxines dans la pomme de terre cultivée en Algérie

Abstract

Cette étude s’intéresse à la présence et à la distribution de mycotoxines fusarienne dans des tubercules de pomme de terre présentant des symptômes de pourriture sèche, ainsi qu’à l’identification des espèces de Fusarium associées, dans deux importantes zones de production de pomme de terre en Algérie : Bouira et Aïn Defla. Un total de 232 tubercules de la variété Spunta a été collecté en 2019 selon un plan d’échantillonnage aléatoire couvrant huit champs répartis sur les deux régions. L’isolement des souches fongiques a été réalisé sur milieux sélectifs : PPA (Peptone Pentachloronitrobenzène Agar) pour la sélection des isolats appartenant au genre Fusarium, PDA (Potato Dextrose Agar) pour l’étude des caractères macromorphologiques et la production in vitro de mycotoxines, et SNA (Spezieller Nahrstoffarmer Agar) pour l’observation des caractères micro-morphologiques. L’identification a été complétée par une analyse moléculaire de la région ITS. Pour l’analyse des mycotoxines, les tissus présentant les symptômes de la pourriture sèche et les mycotoxines produites par les souches de Fusarium cultivées sur PDA ont été examinés par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (LC-MS/MS), après extraction à l’aide d’un mélange acétonitrile : eau : acide formique (79 :20,9 :0,1, v/v/v). Un total de 14 mycotoxines a été recherché : toxine T-2, toxine HT-2, diacétoxyscirpénol (DAS), 15-acétoxyscirpénol (15-AS), nivalénol (NIV), fusarénone-X (FUS-X), néosolaniol (NEO), déoxynivalénol (DON), 3-acétyldéoxynivalénol (3-ADON), 15-acétyldéoxynivalénol (15-ADON), beauvéricine (BEA), zéaralénone (ZEA), fumonisine B1 (FB1) et fumonisine B2 (FB2). Dans la matrice de pomme de terre, cinq mycotoxines ont ete detectees : BEA, toxine T-2, toxine HT-2, DAS et 15-AS. La BEA a ete la plus frequente (97,96 % des echantillons positifs), avec un taux de contamination global de 21,12 % (56,34 % a Bouira contre 5,59 % a Ain Defla). Les autres toxines ont ete retrouvees sporadiquement, uniquement a Bouira, parfois a des concentrations elevees (jusqu fa 171 ƒÊg/kg pour la T-2). Parmi les 283 souches de Fusarium isolees, 57,95 % etaient toxinogenes in vitro sur PDA, produisant principalement la BEA (76,83 % des souches toxinogenes), suivie du DAS (43,29 %), du NEO (37,20 %), du 15-AS (31,71 %), de la ZEA (29,27 %), du FUS-X (4,88 %) et du NIV (2,44 %). Les fumonisines FB1 et FB2 n font ete detectees ni dans la matrice de pomme de terre ni dans les cultures sur PDA. Plusieurs souches ont montré une production simultanée de plusieurs toxines, révélant un phénomène de cooccurrence. L’analyse phylogénétique de 28 souches représentatives a permis de les classer en cinq complexes d’espèces : F. incarnatum-equiseti SC, F. sambucinum SC, F. oxysporum SC, F. tricinctum SC et F. redolens SC, révélant une diversité génétique importante et un potentiel mycotoxigènes marqué. Cette étude confirme la présence de mycotoxines dans des tubercules de pomme de terre atteints de pourriture sèche et met en évidence la forte capacité toxinogène de nombreuses souches de Fusarium. L’existence de cooccurrence des mycotoxines soulève des contraintes supplémentaires dans la gestion des risques, notamment en raison d’effets potentiellement additifs ou synergiques. La prédominance de la BEA, reconnue pour ses effets cytotoxiques, renforce la nécessité de mettre en place des mesures préventives adaptées tout au long de la chaîne de production et de stockage.