Caractérisation des Bactéries endophytes isolées du palmier dattier

Abstract

Notre étude a pour objectif principal la caractérisation des bactéries endophytes isolées des racines du palmier. L’isolement des bactéries endophytes a été réalisé durant l’année 2021 à partir de palmier dattier du Sud Algérien dans deux régions ‘Taghit’ et ‘Kenadsa’ situées dans la Wilaya de Béchar. La caractérisation macroscopique des souches bactériennes a permis d’obtenir différents aspects des colonies montrant une diversité des populations. Parmi la collection, les souches non fluorescentes ont été sélectionnées pour l’identification préliminaire. Un total de vingt-huit isolats a été retenu par le test de fluorescence sur le milieu de culture King B ne présentant aucune fluorescence sous lumière ultra-violet. L’étude des caractères biochimiques et enzymatiques des isolats endophytes a été réalisée par une série de tests d’oxydase, catalase, indole, liquéfaction de gélatine ainsi que la détermination de l’activité amylolytique, lipolytique et la tolérance à la température, la salinité et l’osmolarité. Les résultats biochimiques ont permis de mettre en évidence les genres : Bacillus pour 11 isolas testés (39%), Enterobacter pour 12 isolats (42%) , Pseudomonas non fluorescents pour 2 isolats (7%) , Acinetobacter pour un seul isolat (3%) , Rhizobium pour un isolat (3%) , un seul isolat n’a pas été identifié (3%) . Les tests enzymatiques et de tolérance aux stress abiotiques ont montré des résultats intéressants et une efficacité importante et a permis de mieux s’orienter aux genres d’endophytes performants. D’autre part, les souches bactériennes endophytes étudiées ont été testées pour leur activité antagoniste selon la méthode des stries croisées vis-à-vis de deux bactéries pathogènes ; une souche pathogène à l’homme causant l’infection urinaire ‘Escherichia coli’ et l’autre phytopathogéne, l’agent de tumeur du collet des arbres fruitiers ‘Agrobacterium tunefaciens C58’. Les résultats de test de l’antagonisme ont montré que 93% des souches endophytes ont eu un effet antagoniste avec des diamètres de zones d’inhibition de taille variables entre 6 mm et 15 mm. Les trois souches ; PF43, TCR51 appartenant au genre Bacillus et KFR9 appartenant au genre Enterobacter ont montré une forte activité antagoniste à l’égard des deux bactéries pathogènes avec des zones d’inhibition qui atteignent 15mm est sont considérées comme endophytes performants. En revanche, les deux souches XJ3 appartenant au genre Rhizobium et KMR4 appartenant au genre Bacillus n’ont enregistré aucun effet antagoniste