Contribution à l’étude de la microflore bactérienne bénéfique isolée à partir de la rhizosphère des plantes cultivées

Abstract

Cette étude est portée sur un criblage après l'isolement de bactéries rhizosphériques à partir de la rhizosphère de deux plantes cultivées : le Moringa dans la région d'Adrar et le Colza dans la région de Ouamri, sur milieu GN et KB. 45 isolats bactériens ont été sélectionnés après purification et description macro-morphologique, et ils ont subi le test d'hypersensibilité sur tabac. Seuls les 30 isolats qui n'ont pas présenté de nécroses (saprophytes) ont été soumis à une confrontation vis-à-vis des champignons phytopathogènes (Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici, Fusarium oxysporum f.sp. pisi et Fusarium oxysporum f.sp. lini). Cette confrontation a révélé l'existence de 13 isolats performants présentant une action antifongique, avec des taux d'inhibition allant de 42.5% à 87%. Une deuxième confrontation vis-à-vis des bactéries phytopathogènes (Erwinia amylovora et Agrobacterium tumefaciens) nous a révélé l'effet antibactérien de 17 isolats, avec des zones d'inhibition variant entre 14 mm et 80 mm. Il est à signaler que les isolats antagonistes obtenus ont présenté une variabilité vis-à-vis des agents phytopathogènes (aucun isolat n'a présenté un antagonisme vis-à-vis de tous les agents phytopathogènes testés). Une autre étude a porté sur l'évaluation de la levée de germination des graines de tomate variété Rio Grande bactérisées avec les isolats saprophytes. Les résultats ont été variables, mais la majorité des isolats (AFI1, AFI4, AFI7, AFI8, AFI9, AFII1, AFII5, ASIIB, ASIG, ASIH, ASIJ, ASIL, ASIIB, ASIIG, ASIIH, ASIIN, ASIIP et ASI I) ont présenté un taux de germination allant jusqu'à 100%, par rapport au témoin non bactérisé. On a également remarqué que certains isolats n'ont montré aucune activité de stimulation de la germination (AFI2, AFII2 et ASIF) par rapport au témoin non bactérisé. Concernant la caractérisation générique, 21 isolats présentaient une réaction Gram négative, une forme bacille et un test de KOH positif (sauf les isolats AFI6 et AFI7 qui ont donné une réaction négative), tandis que seulement 09 isolats étaient Gram positifs, avec un test de KOH négatif et des formes variables. Pour le test de catalase, toutes les souches ont montré une réaction positive, à l'exception de deux souches (ASIB et ASID) qui ont donné une réaction négative. En ce qui concerne le test d'oxydase, 20 isolats ont présenté une réaction positive, tandis que 10 isolats ont présenté une réaction négative. Dans le cadre de l'identification des espèces et vu le manque de moyens, seuls les isolats AFII1 et AFI8 isolés de la rhizosphère de Moringa, ainsi que ASIIB qui a été isolé de la rhizosphère de Colza (qui ont présenté des résultats intéressants en termes d'antagonisme et de levée de germination et qui étaient Gram négatifs), ont été sélectionnés pour l'identification biochimique par galeries API (20E et 20NE). Ces tests ont révélé que AFII1 appartient à l'espèce Pseudomonas spp , que l'isolat AFI8 appartient à l'espèce Aeromonas spp, alors que ASIIB appartient à Burkholderia spp