Résumé:
La verticilliose est l'une des maladies les plus graves de l'olivier, causée par un
champignon connu sous le nom de Verticillium dahliae Kleb. Celui-ci a un impact sur
le rendement et la qualité organoleptique des olives. La verticilliose se manifeste par
un desséchement soudain d'un ou plusieurs rameaux ou de branches plus grosses.
L’objectif de notre travail est l’isolement de l’agent pathogène qui cause la
verticilliose chez les oliviers à partir d’échantillons infectés récoltés dans différentes
régions de l’Algérie (Tipaza, Blida, Skikda, Bourdj Bou Arreridj). Après repiquage
successif sur milieu PDA, l’isolat est purifié et ensuite identifié sur le plan
microscopique et macroscopique. Nous avons également effectué une analyse
bioinformatique pour traiter des données informatiques liées à un gène codant pour
une protéine sérine/thréonine kinase qui joue un rôle dans la pathogénicité de l’espèce
V. dahliae. Concernant l’isolement, les tentatives ont échoué, conduisant à l’isolement
de d’autres espèces fongiques comme Alternaria spp.
Cependant, l'étude bioinformatique qui s'est concentrée sur le gène VDAG_05856
codant pour une sérine/thréonine protéine kinase chez V. dahliae, un pathogène
fongique affectant l'olivier. Les résultats ont montré que le gène est localisé sur le
chromosome 4 et caractérisé comme ayant 3 exons, un ARNm de 2547 nucléotides, et
codant pour une protéine de 848 acides aminés. L'analyse phylogénétique a révélé une
proximité génétique entre V. dahliae et V. nonalfalfae, ainsi que des régions
génomiques spécifiques à V. dahliae. La structure tridimensionnelle de la protéine a
été prédite avec une haute confiance, montrant une similarité de 99,5 % avec une
protéine de V. longisporum. Bien que sa localisation subcellulaire précise n'ait pas été
déterminée, elle est probablement cytoplasmique avec une possible association aux
membranes intracellulaires. Son rôle potentiel dans la pathogénicité, la morphogenèse
et l'agressivité du champignon a été discuté
